(一)農業產業聯盟的組織模式
農業產業聯盟是一個多主體的產業組織，其合作伙伴選擇的多樣性、合理性和適應性決定了聯盟的創新方向。在整合資源和整合創新的過程中，聯盟依賴于創新項目團隊的指導和推動。創新項目團隊中的高層領導對創新流程的頂層設計有著至關重要的影響，是推動整個創新管理流程的關鍵力量。同時，高層領導與項目團隊成員之間的信息傳遞關系到創新管理流程的有效支持。除此之外，創新指導能否作為創新思維來實施，與項目組內部成員將創新問題識別和抽象成TRIZ問題的能力密切相關，也就是/kloc-2。能否統一合作方項目團隊成員的相關意見，能否增強項目團隊成員的團隊意識，能否提高知識轉移的效果，成員對農業知識和TRIZ理論等的掌握程度。都體現了農業產業聯盟組織模型創新的特點，對its 創新流程的科學性、流暢性和透明性有一定的影響。
(二)農業產業聯盟的運行機制
影響農業產業聯盟有效運行的相關因素很多。首先，聯盟的組織者需要具備行業內的相關領導技能，能夠充分利用現有資源解決常見的技術問題和應對行業風險，盡早識別聯盟伙伴之間的“搭便車”行為，并確保所有聯盟伙伴根據自身能力提供相應的資源，制定適合每個伙伴的運營模式，實現各方利益最大化。另一方面，創新激勵機制的有效運行有助于提升聯盟的創新能力，充分調動所有合作伙伴的創新思維，增強聯盟所有合作伙伴通過晉升、利益分配等激勵方式解決創新問題的信心和意愿，促進聯盟創新科學有序運行。
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